生物安全柜广泛应用于医疗卫生、疾病预防与控制、食品卫生、生物制药，环境监测以及各类生物实验室等领域，可分为I级、 II级和III级，来满足不同的研究和防疫要求。
其中，I级生物安全柜可以保护工作人员和环境，但不保护样品。II级生物安全柜则是目前应用最为广泛的柜型。而目前世界上最高安全防护等级的安全柜为III级，适用于高风险的生物实验。
生物安全柜作为一种被广泛使用的实验室设备，在使用时除掌握其放置位置、验收时必须检漏外，还必须在使用前与使用后对其进行去污清洁处理。
使用前的准备
1.开始工作前，清除生物安全柜内表面的污染。
2.将所有必需的物品置于安全柜内，以尽可能减少双臂进出前面开口的次数。
物品放置要注意以下6点：
1）II级生物安全柜台面前面和后面的进气格栅不能被物品阻挡；
2）所有物品应尽可能地放在工作台后部靠近工作台边缘的位置，并使其在操作中不会阻挡后部格栅；
3）可产生气溶胶的设备(如：混匀器、离心机等)应靠近安全柜的后部放置。有生物危害性的废弃物袋、盛放废弃吸管的盘子等体积较大的物品，应该放在安全柜内的某一侧；
4）洁净的物品应放置在距离产生气溶胶器皿至少15 cm外，降低交叉污染的可能性；
5）容易受紫外线损伤的实验样本应在实验室紫外线杀菌后放入；
6）尽量不要在生物安全柜工作区内放过多的物品。
3.关闭操作前窗，打开生物安全柜的紫外灯，对生物安全柜工作台面，侧壁表面以及后壁内侧进行杀菌处理。
4.稍微打开操作前窗，让生物安全柜工作区排气几分钟后再开始工作。
使用后的处理
1.系紧用过的生物废物袋。
2.对安全柜内壁、后壁、工作台面和前窗内侧进行清洁和消毒处理。
3.由于剩余的培养基可能会使微生物生长繁殖，因此在实验结束时，包括仪器设备在内的所有物品都应清除表面污染，并移出安全柜。
4.从安全柜内移出手臂之前，一定要进行表面消毒处理，然后垂直于工作区开口缓慢地移出。
6.在每次使用后，要清除生物安全柜内表面的污染。用消毒剂擦拭工作台面和内壁，所用的消毒剂要能够杀死安全柜里的任何微生物。在每天实验结束时，应擦拭生物安全柜的四周以及玻璃的内外侧等部位来清除表面的污染。在对目标生物体有效时，可以采用漂白剂溶液或75%酒精来消毒。在使用如漂白剂等腐蚀性消毒剂后，还必须用无菌水再次进行擦拭。
7.关闭前操作窗口并开启紫外灯
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